Das Amt besteht aus 8 Abteilungen. Die Abteilungen gliedern sich in Unterabteilungen und Referate.
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Das BAFA hat heute rund 1.230 Beschäftigte.
Abteilung Z (Zentralabteilung) ist zuständig für die interne Verwaltung und Organisation.
Abteilungsleiter: Holger Beutel
Die Abteilung 1 (Abschlussprüferaufsichtsstelle APAS) übt die berufsstandsunabhängige Aufsicht über bestimmte Abschlussprüfer in Deutschland aus.
Abteilungsleitung: N.N.
Die Abteilung 2 (Ausfuhr-Verfahren, Genehmigungen, Internationale Regime – Verfahren, Outreach-Projekte) beschäftigt sich mit der Verfahrensseite der Ausfuhrkontrolle.
Abteilungsleiter: Georg Pietsch
Die Abteilung 3 (Ausfuhr-Technik, Technische Stellungnahmen, Internationale Regime – Technik) beschäftigt sich mit der technischen Seite der Ausfuhrkontrolle.
Abteilungsleiter: Dr. Thomas Jennen
Die Abteilung 4 (Wirtschafts- und Mittelstandsförderung) ist mit Förderprogrammen im Rahmen der Wirtschafts- und Mittelstandsförderung betraut.
Abteilungsleiterin: Martina Becker
Die Abteilung 5 (Energieeffizienz, Erneuerbare Energien, Besondere Ausgleichsregelung) ist verantwortlich für Aufgaben und Förderprogramme im Bereich der Erneuerbaren Energien und der Energieeffizienz.
Abteilungsleiterin: Heidi Motsch
Die Abteilung 6 (Klimaschutz Gebäude, Energie-Info-Center, Anpassungsgeld) ist verantwortlich für Förderprogramme im Bereich der Gebäudeenergieeffizienz und administriert das Anpassungsgeld für Beschäftigte des Kohletagebaus.
Abteilungsleitung: Venio Piero Quinque
Die Abteilung 7 (Lieferkettensorgfaltspflichtengesetz) ist verantwortlich für die Umsetzung des Lieferkettensorgfaltspflichtengesetzes.
Abteilungsleitung: N.N.
